Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms