Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms