Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP9Q99956 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms