Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms