Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC38A2Q96QD8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms