Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms