Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC7Q96NW7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC7Q96NW7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms