Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms