Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms