Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCC11Q96J66 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms