Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIPA1Q96FS4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms