Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms