Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPTQ96BT3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms