Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EXOSC8Q96B26 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EXOSC8Q96B26 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EXOSC8Q96B26 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC8Q96B26 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC8Q96B26 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC8Q96B26 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EXOSC8Q96B26 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms