Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms