Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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TRIM63Q969Q1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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TRIM63Q969Q1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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TRIM63Q969Q1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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TRIM63Q969Q1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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