Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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