Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3AQ92484 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms