Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCAF4Q8WV16 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms