Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms