Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD1Q8NHV4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms