Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms