Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC63Q8NA47 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms