Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD53Q8N9V6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD53Q8N9V6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms