Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFRP1Q8N474 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFRP1Q8N474 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP1Q8N474 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms