Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms