Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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RAB11FIP4Q86YS3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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RAB11FIP4Q86YS3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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RAB11FIP4Q86YS3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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RAB11FIP4Q86YS3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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RAB11FIP4Q86YS3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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RAB11FIP4Q86YS3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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RAB11FIP4Q86YS3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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RAB11FIP4Q86YS3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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RAB11FIP4Q86YS3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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RAB11FIP4Q86YS3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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RAB11FIP4Q86YS3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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RAB11FIP4Q86YS3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP4Q86YS3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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