Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOM1L2Q6ZVM7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms