Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BEND4Q6ZU67 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms