Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TPGS1Q6ZTW0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms