Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms