Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms