Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms