Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED9Q6R2W3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms