Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CARMIL2Q6F5E8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms