Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIRMAQ69YN4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms