Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102BQ68D86 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms