Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNS3Q68CZ2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms