Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms