Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms