Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSBN1Q5VWQ0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms