Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYOM3Q5VTT5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms