Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GKAP1Q5VSY0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms