Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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COL5A1-AS1Q5SY13 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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COL5A1-AS1Q5SY13 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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