Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms