Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms