Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TDRD12Q587J7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD12Q587J7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms