Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPAT3Q53EU6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms