Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms