Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM259Q4ZIN3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms